Факультет комп’ютерних наук - один з найпрогресивніших, інноваційних та динамічних факультетів університету, який стрімко розвивається. Факультет комп'ютерних наук було створено у лютому 1996 року для підготовки спеціалістів по сучасним напрямам в області інформаційних технологій. На ФКН сформувався унікальний професорсько-викладацький колектив: 11 докторів наук, професорів, близько 30 кандидатів наук, доцентів, велика кількість викладачів являються практикуючими співробітниками ведучих IT – фірм Миколаєва. Успішному навчанню на факультеті сприяють не лише кваліфіковані науково-педагогічні кадри, які створили свої напрями в наукових дослідженнях, але й належна навчально-матеріальна база. Це, в першу чергу, комп’ютерні класи, обладнані сучасною комп’ютерною технікою. Освіта, яку отримують на факультеті, має міжнародний рівень конкурентоспроможності у багатьох сферах, де використовуються інформаційні комп’ютерні технології. Цінність отриманої на факультеті освіти визнається в Україні, у країнах Європи та Америки, що підтверджує велика кількість випускників, що працевлаштовані у цих країнах. Ключова особливість ФКН - тісна взаємодія з ведучими IT- компаніями при формуванні стратегії розвитку та організації учбового процесу.